Cypher VRS视频级AFM的应用视频

描述

DNase1是一种非特异性裂解DNA的酶。在这个实验中，我们利用Cypher VRS来监测lambda 消化DNA上DNase1的作用。简而言之，DNA被绑定到一个带有MgCl₂缓冲剂的云母基质上，并引入了DNase。该测量用的是轻敲模式，线速625 Hz，像素320 x 64，奥林巴斯AC10探针，帧速为每秒8.7帧（fps）。在视频的旁边，我们放置了三个关键的帧，它们的间隔时间仅为2.5秒。在第一幅图中（顶部），我们观察到几个DNA链；在第二幅图中（中间），我们看到了绑定一条重叠链（圆圈）的DNase酶；在第三幅图中（底部），这条链在绑定点上被裂解。

描述

在这个实验中，我们捕捉到了半圆柱形胶束的动态过程（形成于2 mM CTAB溶液中，在HOPG表面迁移）。这些胶束通常相当稳定，所以我们在少量的异丙醇中进行灌注，以诱导动态的出现。在这些视频中，成像图的像素是200 x 200像素，速度为每秒2.4帧。为了更清楚地显示动态，这里的回放速度是采集速度的6倍。

Celgard聚丙烯成像图（在空气中，帧速为2.4 fps）

聚己内酯聚合物成像图（在空气中，帧速为1.3 fps）

DNA成像图（帧速为1 fps，双螺旋分辨率）

描述

我们用常规的方式准备了一块Lambda消化DNA样品，以用于成像。在准备过程中，我们让DNA溶液（1 μg/µL λDNA 在10 mM NiCl₂中）吸附在一个新裂解的云母片上。我们把这个样品安置在Cypher VRS原子力显微镜上用于成像，然后引入一份100 mM的氢氧化钾溶液，以导致DNA变性（即：分解DNA的双螺旋结构，进而形成单链DNA）。之后，我们立即使用Asylum Research Cypher VRS原子力显微镜进行视频速率的成像，扫描速度为每秒625行，使用Olympus AC10探针，扫描尺寸为160 nm，每行448个点，共52行，有效帧速为：每秒9.19帧。该视频的回放速度与采集速度相同（即：1倍于采集速度）。 

最初的几帧显示了预期中的未受损DNA结构，但是与单链DNA相应的细链很快出现，通常看起来仍然与原始DNA链相连。

描述

利用Asylum Research Cypher VRS进行测量的成像图，线速100 Hz，像素312×64；使用的是Olympus AC10探针，帧速为1.56 fps，回放速度是采集速度（15.6 fps）的10倍。